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提速近10倍!基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

  近日,中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用,将助力深度学习在全基因组选择中的应用,为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物(Molecular Plant)》上。

  全基因组选择作为新一代育种技术,通过构建预测模型,根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择,从而缩短育种世代间隔,加快育种进程,节约成本,推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

  统计模型作为全基因组选择的核心,极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型,难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

  相较于传统模型,非线性模型(如深度网络神经)具备分析复杂非加性效应的能力,人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机,深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

  该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料,通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

  与其他五种主流预测方法相比,该方法有以下优点: 可以利用多组学数据开展全基因组预测;算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构,可以有效降低模型错误率,提高运行速度;预测精度稳健,在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当,在大规模数据集上预测优势更加明显;计算时间与传统方法相近,比已有深度学习方法提速近10倍;超参数调整对用户更加友好。

  该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

 

《TopBrand2022中国品牌人物500强》发布:科技行业81人上榜******

  中新网1月11日电 题:《TopBrand2022中国品牌人物500强》发布:科技行业81人上榜

  中新财经记者 夏宾

  近日,由品牌联盟(Topbrand Union)主办的“2022中国品牌节年终盛典”在京举行。品牌联盟董事长、中国品牌节发起人兼秘书长王永揭晓了七项榜单,并从多维度对《TopBrand2022中国品牌人物500强》等研究性榜单上榜品牌的总体特征进行了分析解读。

  其中,任正非、董明珠、俞敏洪三位民营企业家,成为2022中国品牌人物前三甲。杨振宁、张桂梅、曹德旺、谷爱凌、刘强东、屠呦呦、王传福分居4至10名。

  从总体行业分布看,科技行业入榜人数最多,共81人,占比16.24%;零售行业共54人上榜,排名第二,占比11.12%;体育第三,共45人,占比9.62%。

  从性别来看,共有379位男性品牌人物上榜,占比75.8%;品牌女性上榜数达到了121人,占比24.2%。

  从年龄来看,上榜品牌人物年龄平均值为58.67岁,年龄分布较集中。年龄最小的全红婵,仅有为16岁;年龄最大的杨振宁,已是101岁高龄。

  王永表示,具体到行业分布,科技行业表现领先。汽车行业也表现不俗,老牌民营企业家曹德旺、王传福、李书福,理想汽车创始人李斌以及中国第一汽车集团有限公司党委书记、董事长徐留平,都进入了TOP50,艺术、医学、文学、体育类别的品牌人物也表现不俗。

  据悉,《2022中国品牌人物500强》是由品牌联盟选取中国5000余位知名品牌人物(包含港澳台地区)样本,并参照多项权威名录遴选大量社会名流、知名企业代表等品牌人物构建而成。

  根据品牌人物的行业话语权、社会影响力、社会责任、公众形象、关注度等重要指标综合评估品牌人物指数,按照综合指数排序,公布了位居前500名的品牌人物名列。(完)

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